第二集中(zhōng )，尼奥（基(✒)努(nǔ )·里(📼)维斯 Keanu Reeves 饰）没有能从内(🥈)部摧(cuī )(🛤)毁“母体”，他的身体在真实世界(jiè )的(de )飞船上陷于昏迷，思想却(🕔)被困在介(jiè )于“母体”和真(🙍)实世界的(de )中间(jiān )地(dì )带，这个地(📞)方由“火车人”控制。墨菲斯（劳(🕕)伦斯·菲(🤷)什伯恩(ēn ) Laurence Fishburne 饰）和崔(cuī )妮(nī )蒂（凯瑞(ruì )-安(ān )·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）(🚻)等人知(⛳)道了(💠)尼奥的情况，在守(shǒu )护天使(shǐ )的带领下(🌮)， 找(🤘)到了“火车人(rén )”的(🍑)控制者(zhě )梅罗纹(🦇)奇，经过一(🐛)番激斗(🐨)，将(jiāng )尼奥(🃏)救(jiù )了出(chū )来。　　(🐩)此时(😝)，电(diàn )子(zǐ )乌(💿)贼部队(duì )对锡安发起(🤥)了(⏲)猛烈(liè )(🔤)的攻击，人类组织所有机(jī )甲(🏃)战士展开顽强的抵抗(kàng )(👄)，形势危在旦夕；尼奥和崔妮蒂驾(jià )驶了一艘飞船克服(fú )重重困难，到(dào )达机器(🤼)城市，尼奥终于见到了机器世界的统治(zhì )者“机器大帝”，双方(fāng )谈(🚪)判(🐌)并(bìng )达(🖱)成了协议(🐅)：尼奥除掉不受(shòu )“母(🍾)体(🕵)”控(kòng )(🚓)制的(de )(🐇)史(shǐ )密斯(🔍)，以换(🗒)取(🏆)锡安(ān )的和(hé )平。　(🍝)　在(zài )“母体”中，尼(♟)奥和史密斯展开了关系人类生死存(👡)亡的(🐼)最后(⛱)决斗(🖥)。